Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PIP4K2BP78356 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms