Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPEP62304 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms