Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms