Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms