Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms