Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA4P52798 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms