Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LUMP51884 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LUMP51884 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LUMP51884 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LUMP51884 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms