Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms