Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms