Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLMP48507 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLMP48507 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms