Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms