Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA4P34932 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA4P34932 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms