Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CTGFP29279 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTGFP29279 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTGFP29279 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms