Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms