Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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