Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASTP20810 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASTP20810 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASTP20810 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASTP20810 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASTP20810 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASTP20810 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASTP20810 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASTP20810 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASTP20810 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASTP20810 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASTP20810 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASTP20810 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASTP20810 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASTP20810 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms