Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL3P19876 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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