Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR2AP13861 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR2AP13861 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms