Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms