Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM1P13164 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms