Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLK3P07288 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLK3P07288 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLK3P07288 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLK3P07288 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLK3P07288 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLK3P07288 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLK3P07288 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLK3P07288 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms