Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPBP07199 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPBP07199 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPBP07199 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPBP07199 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPBP07199 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms