Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms