Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms