Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TYMSP04818 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TYMSP04818 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms