Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-AP01891 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-AP01891 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms