Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP1P01033 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms