Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR1AO95602 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms