Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms