Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCP110O43303 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCP110O43303 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCP110O43303 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms