Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms