Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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