Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms