Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT4C9JH25 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT4C9JH25 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms