Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms