Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A6NIN4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NIN4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NIN4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NIN4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NIN4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NIN4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NIN4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms