Protein–RNA interactions for Protein: A6NF89

OR6C6, Olfactory receptor 6C6, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR6C6A6NF89 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OR6C6A6NF89 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms