Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms