Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQE9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQE9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQE9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQE9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQE9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms