Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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