Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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