Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRELID3BQ9Y3B1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms