Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms