Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms