Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms