Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms