Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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