Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLKQ9UBT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms