Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCDC180Q9P1Z9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCDC180Q9P1Z9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms