Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTEL1Q9NZ71 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTEL1Q9NZ71 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTEL1Q9NZ71 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1Q9NZ71 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms